Christian Haydn studierte ab 1996 Physik an der Universität in Regensburg. Weiterhin nahm er an einem Austauschprogramm mit der Wesleyan University in Connecticut, USA, teil. Im Anschluß daran arbeitete er während eines zweimonatigen Forschungsaufenthaltes an der Weselyan University. 2001 beendete er sein Studium mit der Diplomarbeit zum Thema "Studying the Spectral Evolution of Stellar Populations using Artificial Neural Networks", die er am Max-Planck-Institut für Astrophysik anfertigte.

Nach seinem Studium war Christian Haydn am Max-Planck-Institut für Astrophysik als wissenschaftlicher Mitarbeiter tätig und während seiner Ausbildung zum deutschen Patentanwalt war er zwei Monate in einer US Kanzlei in Boston und New York.

Christian Haydn wurde 2007 als deutscher Patentanwalt und als European Patent Attorney zugelassen, nachdem er seine Ausbildung bei Müller-Boré, beim Deutschen Patent- und Markenamt und beim Bundespatentgericht abgeschlossen hatte.

Christian Haydn ist seit 2003 für Müller-Boré tätig und wurde 2009 Partner.